投加磁粉，并投加混凝劑，使污染物與磁粉絮凝結合成一體，形成帶有磁性的絮凝體，從而使原本沒有磁性的污染物具有磁性，然后通過高梯度磁分離技術或自身的沉降，使具有磁性的絮凝體與水體分離，從而將污染物去除。

磁絮凝在水處理中的應用
1.市政污水市政污水是造成水體污染的重要原因，其處理效果越來越受到人們重視。與傳統生物處理相比，投加混凝劑的化學強化一級處理具有自然條件約束少、占地省、流程短、處理速度快、基建與運行費用低、操作靈活等特點。此外，磁絮凝技術還有簡單經濟、能快速沉降和分離、污泥含水率低等優點，故而成為極具競爭力的城市污水處理方法。
2.含磷廢水飲用水中的磷主要通過與混凝劑形成沉淀以及與非溶解性的磷形成礬花而被去除。當絮凝效果好時，大部分的磷可由絮凝沉淀去除。但是在常規絮凝除磷中，絮體一般較為松散，沉降性能差，處理構筑物占地面積大且出水效果也不穩定，而磁絮凝能強化絮凝效果，使形成的絮體粒徑增大，密實度增加，易于沉降，從而加強系統對總磷的去除效果。
3.含油廢水磁粉本身對廢水中的油類和膠態物質具有良好的吸附能力。而絮凝劑能通過絮凝作用包括油類物質和其他懸浮物形成絮凝體從而使油水分離。